Добрый день! 
1. Уретерокутанеостома выделяет мочу из почек, поэтому моча будет содержать те примеси, которые образуются в почках. Раньше с этим справлялся мочевой пузырь, теперь вся моча сразу оттекает в мочеприемник. 
2. Промывать катетеры категорически нельзя! Вас должен был об этом предупредить Ваш лечащий врач - промывая, Вы под давлением вносите в почку инфицированную мочу с бактериями, что может вызывать любой ответ организма - начиная от рецидива пиелонефрита, заканчивая уросепсисом. Промывать катетеры нельзя ни в коем случае! 
3. Если есть повышенное солеобразование, то имеет смысл менять катетеры чаще - к примеры 1 раз в месяц - обсудите это с врачом. 
4. Сдайте общий анализ мочи (из каждой почки по отдельности), посевы мочи на флору (тоже по отдельности). После этого можно будет решать вопрос о какой-то медикаментозной коррекции, коррекции диеты, водного режима. 
5. Сразу предупрежу - если анализ мочи будет плохой и выявятся бактерии - это еще не повод для назначения антибиотиков. Они будут необходимы ТОЛЬКО при наличии повышенной температуры! 
С уважением.